揭示核心启动子变异在三阴性乳腺癌中的作用

• 2023-07-27 17:40:17 来源：互联网

(资料图片仅供参考)

TNBC 是一种特别具有侵袭性的乳腺癌亚型，其特征是缺乏三种关键受体：雌激素受体 (ER)、孕激素受体 (PR) 和人表皮生长因子受体 2 (HER2)。所有乳腺癌中大约 10-20% 是 TNBC。由于缺乏特定的药物靶点，TNBC 患者的预后较差。因此，发现影响TNBC发生和进展的新因素对于改善患者预后至关重要。

发表在《基因与疾病》杂志上的一项研究以核心启动子(围绕转录起始位点 (TSS) 的 DNA 区域)为中心，探讨了核心启动子遗传变异在 TNBC 异常基因表达中的潜在作用。核心启动子包含多个高度保守的顺式基序，与不同的转录因子(如 RNA 聚合酶 II、TFIIB 和 TFIID)相互作用。

这种相互作用形成转录起始复合物来调节转录起始。核心启动子序列中的遗传变异可能会干扰这种相互作用，从而干扰转录起始复合物的正确组织，导致转录起始改变和病理后果。

研究人员推测，TNBC 的核心启动子可能存在高度变异，导致其基因表达异常。为了检验他们的理论，他们使用一种称为基于外显子组的核心启动子变异检测 (EVDC) 的方法分析了 279 名 TNBC 患者的基因组。

在过滤掉正常的基因组多态性后，研究人员在各种基因的核心启动子中发现了惊人的 19,427 个复发体细胞变异和 1,694 个复发种系变异，其中许多已知是癌基因和肿瘤抑制基因。

对乳腺癌 RNA-seq 数据的分析揭示了数百个受影响基因的基因表达发生改变，这提供了核心启动子变异可能显着影响基因表达的实质性证据。研究人员进一步将这些发现与 610 个未分类乳腺癌的核心启动子变异数据进行了比较。有趣的是，TNBC 的核心启动子变异具有高度的 TNBC 特异性，这表明这些变异可能对 TNBC 的独特特征做出重大贡献。

这项研究清楚地表明，核心启动子是可变的，并且可以显着促进癌症，特别是 TNBC 的发展。虽然它揭示了癌症研究的一个全新方面，但仍有很多东西有待发现。

标签：

推荐阅读

猜您喜欢